调查组通过现场调查得知，阳关林场管理较为粗放，日常工作存在薄弱之处，从而致使媒体所反映的一些问题得以发生。

一是林木抚育工作存在不规范的情况。阳关林场在进行林木更新改造时，把部分区域中老化枯死的新疆杨等乔木进行了采伐，之后补种了梭梭、红柳等灌木树种。这样一来，林场的乔木林地面积有所减少，而灌木面积有所增加。尤其在林地承租期间，也就是 2007 年至 2017 年间，乔木面积减少了 1000 余亩。

一是林木更新采伐管理存在不足。从现场调查的状况而言，此前阳关林场在雇佣工人进行老化枯死树木采伐作业时，由于林场管理不够严格，个别工人出现违规操作的情况，他们将 10 余棵尚未完全枯死的行道树从底部锯断，从锯断面能够清晰看到明显的活木痕迹。

三是水资源节约利用方面存在不足。目前阳关林场均以大水漫灌的形式进行灌溉。节水工作进展较为缓慢，并且为了保障农户种植葡萄有足够的用水，林地用水在一定程度上受到了影响。

一是 2007 年阳关林场将 5000 亩林地出租给 3 家企业经营；二是林场出租林地的审批程序不够规范；三是合同文本不够完整；四是承租后管理未跟上，致使承租期间林地更新改造和抚育工作不力。敦煌飞天公司为了发展鱼类养殖产业，在阳关林场上游的西土沟实施了多项工程，包括拦洪坝、月亮湖、九连湖和十三条防洪坝等。这些工程将西土沟河截流改道，使得河道下段的溢水泉眼被风沙封堵，从而影响了下游阳关林场的农业生产和生态灌溉用水。